Genetikos skonis: elektroforezės MiniLab TAE MiniOne M6010TAE - visapusiškas ir giliausias biologijos laboratorinis rinkinys, apimantis tris didžiąsias AP biologijos idėjas viename komplekte. Mokiniai ištiria TAS2R38 geną - vieną iš geriausiai ištirtų žmogaus genų - atlikdami savo DNR išskyrimą, PGR amplifikaciją, restrikcinio fermento HaeIII analizę ir gelio elektroforezę. Rinkinys apima genetinę analizę, bioinformatiką, populiacijų genetiką ir evoliuciją.

Pirmiausia mokiniai nustato savo fenotipą ragaudami PTC popierių - ar jie jautėjai, ar nejautėjai kartumo. Tada išskiria savą DNR iš žandų ląstelių, amplifikuoja 221 bp TAS2R38 geno regioną su PGR, pjausto HaeIII restrikciniu fermentu (jautėjų alelis pjaustomas į 176 bp ir 45 bp fragmentus, nejautėjų - ne) ir vizualizuoja rezultatus elektroforeze. Paskutiniame etape mokiniai lygina savo genotipą su fenotipu ir nagrinėja PTC pojūčio dažnį žmonių populiacijoje.

Ugdomos sąvokos ir laboratoriniai įgūdžiai:

• TAS2R38 geno struktūra ir SNP (vieno nukleotido polimorfizmas)
• DNR išskyrimas iš žandų ląstelių
• PGR amplifikacija specifiniam geno regionui
• Restrikcinio fermento HaeIII pjūvis ir DNR fragmentų analizė
• Genotipo ir fenotipo ryšys
• Populiacijų genetika ir PTC pojūčio dažnio analizė
• Bioinformatika ir evoliucija (AP pratęsimo veiklos)

Komplekto sudėtis (40 mokinių, 10 darbo vietų, 4 mokiniai kiekvienoje):

• DNR išskyrimo tirpalas
• Praimeriniai rinkiniai TAS2R38 genui
• FastTaq Master Mix (2X)
• HaeIII restrikcinis fermentas su skiedimo buferu
• MiniOne 5X mėginių krovimo dažiklis
• MiniOne DNR žymeklis
• 0,2 ml plonasieniukai PCR mėgintuvėliai
• 0,65 ml mikrocentrifugos mėgintuvėliai
• 40 vnt. PTC skonio popierių ir kontrolės popierių
• 10 puodelių 2% GreenGel agarozės
• 100 ml TAE buferinio tirpalo koncentrato
• 2 g valgomosios druskos
• Mokytojo vadovas
• Mokinio vadovas

Pastaba: reikalingas MiniOne PGR sistema ir centrifuga min. 8000 RPM (tiekiami atskirai). Laikoma 4°C, stabilu 3 mėnesius.

Pagrindinės savybės:

• Trys AP biologijos didžiosios idėjos viename rinkinyje
• Asmeninė patirtis - mokiniai tiria savo pačių DNR
• Trijų pamokų laboratorija (3 × 50 min.)
• HaeIII restriktinis fermentas - SNP identifikavimas
• TAE buferio versija
• Tinka 9–12 klasių ir AP biologijos mokiniams
• Gamintojas: MiniOne Systems, JAV